门头沟区初中学校共计12所，包含优质高中所属初中、其他初中，具体名单如下：
| 门头沟区12所初中学校名单及类别 | |
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| 学校名称 | 学校类别 |
| 北京市大峪中学分校 | 优质高中所属初中 |
| 首都师范大学附属中学永定分校 | 优质高中所属初中 |
| 北京市大峪中学 | 优质高中所属初中 |
| 北京市门头沟区新桥路中学 | 其它初中 |
| 北京市门头沟区京师实验中学 | 其它初中 |
| 北京市门头沟区潭柘寺中学 | 其它初中 |
| 北京市门头沟区军庄中学 | 其它初中 |
| 北京市门头沟区妙峰山民族学校 | 其它初中 |
| 北京市王平中学 | 其它初中 |
| 北京市门头沟区斋堂中学 | 其它初中 |
| 北京市门头沟区清水中学 | 其它初中 |
| 北京市三家店铁路中学 | 其它初中 |
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