2016年，北京市第5中学全国中学生学科竞赛成绩优异。

　　高三学生王镕祥、李木子、黄子康分别在第25届全国中学生生物竞赛中获北京赛区一等奖。其中，王镕祥、李木子2名同学代表北京市在全国决赛中获得金牌;高三学生黄逸帆、马丞泽在第30届全国中学生化学奥林匹克竞赛中获北京赛区一等奖;高一学生高国荃、高三学生李研在第32届全国中学生数学联赛中获得北京市一等奖;高三学生余江晖在第33届全国中学生物理竞赛中获北京赛区一等奖。